核糖体是细胞中合成蛋白质的必要细胞器,也是许多抗生素的作用靶点,现有的靶向核糖体的抗生素一般作用于蛋白质的翻译过程。近年来,对核糖体组装的调控已被证实对核糖体的功能有重要影响,因而可用于新药物靶点的发现。而新靶点的发现对于具有全新作用机制的抗生素的开发有重要意义,将为应对目前日益严重的病原菌耐药性问题提供指引。然而,核糖体的调控数据,尤其是核糖体的相互作用蛋白质的数据分布零散,至今仍无专门收集储存核糖体蛋白质及与核糖体相互作用蛋白质的数据库。在本研究中,我们建立了核糖体相互作用蛋白质数据库(RIBOi,www.riboi.org),该数据库涵盖了四种真核模式生物(人类、大鼠、小鼠和斑马鱼)和六种病原菌(结核分枝杆菌、大肠杆菌、鼠伤寒沙门氏菌、克雷伯氏肺炎菌、霍乱弧菌和耶尔森氏鼠疫杆菌),共计642种核糖体蛋白以及119,326条核糖体相关蛋白质-蛋白质相互作用。除此之外,RIBOi数据库还整合了一系列常用的蛋白质在线分析工具,用于进一步的功能注释和通路分析等。RIBOi数据库中与核糖体相关蛋白质的蛋白质-蛋白质相互作用网络将能为基础研究和药物开发提供新的思路。