印度洋深海沉积物真菌和放线菌多样性及其抗菌活性

来源 :第十三届全国抗生素学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:smartdudu
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  当前,细菌耐药特别是革兰氏阴性菌的耐药性对人类健康构成了严重的威胁.临床上安全有效的治疗多药耐药革兰氏阴性菌感染的药物极度缺乏,全球范围内处于临床研究的抗阴性菌候选药物更是寥寥无几.2017年,世卫组织根据对新型抗生素的迫切需求程度将其分为极为重要、十分重要和中等重要三个类别.其中,列为极为重要的包括碳青霉烯耐药的鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌和产超广谱β-内酰胺酶(ESBLS)肠杆菌科三种阴性菌的抗感染药物.随着对微生物资源的开发,从陆生微生物中发现新结构抗生素越来越困难.随着微生物资源的探索,海洋环境以其特有的高盐、高压、低温、低营养等独特环境,微生物可能存在特有的代谢途径,而产生具有特殊结构和生理活性的次级代谢产物.对印度洋孟加拉湾8份深海沉积物样品进行了放线菌和真菌的分离.在放线菌的分离过程中采用差速离心法,样品印章法,加热稀释法三种预处理方法[1],共六种培养基进行放线菌的分离培养.共得到细菌73株,通过PCR扩增16SrRNA基因序列,并在NCBI上进行比对确定其覆盖放线菌门、变形菌门、拟杆菌们、厚壁菌门4门,共9个科,13个属.其中放线菌门包括7个属26株,分别为诺卡氏菌属(Nocardia),红球菌属(Rhodococcus),细杆菌属(Microbacterium)罗思氏菌属(Rothia),糖单孢菌属(Saccharomonospora),链霉菌属(Streptomyces),马杜拉放线菌属(Actinomadura),其中有3株菌为潜在新种.在真菌的分离过程中对8份样品采用印章法和梯度稀释法两种样品处理方法[2],利用PDA,MEA,Czapek–Dox Medium,GPA,GYMA等5种培养基进行培养[3].总共分离得到真菌24株,通过PCR扩增18S rRNA基因序列并进行序列比对确定其对分布于5个属,分别为曲霉菌属(Aspergillus),青霉菌属(Penicillium),踝节菌属(Talaromyces),蒜孢属(Rachicladosporium),念珠菌属(Candida).其中曲霉属和青霉菌属为优势菌,分别为7株和6株.对真菌进行液体及固体发酵,液体发酵用大孔吸附树脂吸附处理,菌丝体用丙酮萃取,浓缩后用纸片扩散发测定其活性.固体发酵选用大米培养基,发酵30天后,分别用乙酸乙酯及甲醇萃取,产物浓缩,用纸片扩散法测定其抑菌活性.利用铜绿假单胞菌11,大肠埃希菌,铜绿假单胞菌,肺炎克雷伯菌,金黄色葡萄球菌进行抗菌活性筛选得到活性菌株9株,对肺炎克雷伯菌,铜绿假单胞菌等显示出较强活性.
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