鸡LIF基因mRNA组织表达RT-PCR半定量测定分析

来源 :第十六次全国家禽学术讨论会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zgkjzh1
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选取饲养环境条件一致的海兰褐蛋鸡10只,在240日龄时分别采集心、肝、脾、肺、肾、卵巢、输卵管、脑组织和胸腺,迅速收集并置于液氮中冷冻,-80℃保存样品待用。所采组织样用Trizol法提取总RNA,经琼脂糖凝胶电泳检测,并测定浓度,-80℃保存以备反转录。按照试剂盒说明书提供步骤进行RNA反转录,合成DNA。根据NCBIGenBank中已收录的鸡LIF基因DNA序列(NCBI Reference Seguence:NC-006102.3)设计一对特异引物:上游引物5-GGTGAGGATTGGGCAGAAAC-3、下游引物5-CAACCCTACACGGGACAGATT-3;以GAPDH基因为内标,上游引物:5-ATGGCATCCAAGGAGTGA-3、下游引物:5-GGGAGACAGAAGGGAACAG-3 ,用半定量RT-PCR检测LIF基因在海兰褐鸡9种不同组织的mRNA表达水平差异。通过ImageJ2x软件分析RT-PCR产物灰度值,各组织mRNA的相对表达量用每个样品mRNA的表达量与内参基因GAPDH mRNA的表达量的比值表示。结果表明,扩增获得了鸡LIF基因片段长度为496 bp,GAPDH基因扩增片段长度为141bp。海兰褐蛋鸡在240日龄时的心、肝、脾、肺、肾、卵巢、输卵管、脑和胸腺组织中均有表达。相对表达量依次是0.0609、0.0537、1.5483、0.8186、0.3067、0.1025 、0.4275、0.6163、0.2827。其中,在脾脏中的LIFmRNA表达水平最高,其次是肺脏,在心、肝脏、卵巢组织中的mRNA表达水平相对较低。此表明,鸡LIF基因mRNA在体内组织分布较广、表达水平不均匀。
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以白番鸭为父本,M18、大型、中型和小型4个母本种鸭为母本,每个亲本及其杂交后代半番鸭各100120只,共9001 180只。饲养至70日龄,每组选取平均体重6只供屠宰实验,每组随机采血40只。选用了8个微卫星引物作为实验位点。用8%变性聚丙烯酞胺凝胶电泳检测,电泳结束后银染显色、分型。根据遗传距离公式计算出各亲本间的奈氏遗传距离(DA),其中番鸭♂×M18♀的遗传距离最大,其次为番鸭♂×中型♀、
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