利用Solexa测序技术发掘银杏microRNA

来源 :全国第二十次银杏学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wdj702
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microRNA(miRNA)主要是在转录后水平上通过介导靶基因mRNA的裂解或抑制翻译来调控生物基因的表达,在植物生长发育和胁迫响应等方面发挥着重要调控作用.本研究利用基于Solexa原理的小分子RNA深度测序技术,并结合生物信息学的方法对胚珠发生时期的银杏叶片中保守和预测miRNA类型、表达丰度及靶基因进行了分析.研究共发现隶属于23个miRNA家族的80个保守的miRNA,其表达丰度在1~338015之间,其中包含一个可能为裸子植物特有的miR1314.此外,还预测6条新miRNA,其中2个为多基因座miRNA.靶基因预测发现功能涉及转录调控、胁迫响应和信号转导等过程,为研究miRNA在银杏胚珠发生和发育过程中的调控机理奠定良好的基础.
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