【摘 要】
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应用SignaIP 3.0、TMHMM 2.0,THUMBUP、big-PI、TargetP 1.01、Lipop 1.0、TatP 1.0等7种软件分别对马铃薯青枯病菌Ralstonia solanacearum GMI1000染色体与质粒基因组共5,129个氨基酸序列进行预测比对分析.结果表明,该物种具信号肽的分泌蛋白有263个,其中染色体基因组分布有178个,占其基因组编码蛋白的5.2％;而
【机 构】
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云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所,云南 昆明 650223;云南省农业生物技术重点实验室,昆明 650223
【出 处】
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2008年中国植病、菌物学会杭州联合年会
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应用SignaIP 3.0、TMHMM 2.0,THUMBUP、big-PI、TargetP 1.01、Lipop 1.0、TatP 1.0等7种软件分别对马铃薯青枯病菌Ralstonia solanacearum GMI1000染色体与质粒基因组共5,129个氨基酸序列进行预测比对分析.结果表明,该物种具信号肽的分泌蛋白有263个,其中染色体基因组分布有178个,占其基因组编码蛋白的5.2％;而质粒基因组有85个,占5.1％,二者所占比例几乎一致.此外,我们发现该物种质粒与染色体基因组编码的分泌蛋白在信号肽氨基酸种类及分布,信号肽酶切割位点氨基酸组成及分泌蛋白在各自基因组编码蛋白中所占比例均十分接近,这提示我们该病原微生物中质粒与染色体在进化上具有很高的亲缘关系,为研究其它微生物质粒与染色体的进化及起源提供参考.
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