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“十二五”初期，中国政府的多项发展规划提出了医药产业组织结构调整的政策目标。基于产权分割和专业化分工理论，本文采用Panel Data模型的实证分析研究方法，对中国医药产业组织结构调整路径进行探索和研究，为各级政府实现“十二五”期间战略目标提供决策支持。分化分层和兼并重组是医药产业组织结构调整的两种方案，医药产业的研发和生产领域要以选择分化和分层的调整方式，以实现医药产业结构调整和优化升级。