基于生物信息学分析的子宫内膜异位症miRNA-mRNA调控网络的初步构建

来源 :中国现代医学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：ligc66

【摘要】

：

目的用生物信息学分析方法初步构建子宫内膜异位症miRNA-mRNA的调控网络,探索其在子宫内膜异位症中的分子调控机制。方法从GEO下载数据集GSE7305,使用R语言软件对其进行差异

【作者】

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姜丽章蒙蒙王思雪曹乐周雨馨方小玲

【机构】

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中南大学湘雅二医院妇产科

【出处】

：

中国现代医学杂志

【发表日期】

：

2020年9期

【关键词】

：

子宫内膜异位症 miRNA 基因芯片差异表达基因调控网络

【基金项目】

：

国家自然科学基金(81671437);湖南省科技研发重点项目(2016JC2049)

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目的用生物信息学分析方法初步构建子宫内膜异位症miRNA-mRNA的调控网络,探索其在子宫内膜异位症中的分子调控机制。方法从GEO下载数据集GSE7305,使用R语言软件对其进行差异表达基因分析。使用DAVID在线网站对获得的差异表达基因进行基因功能和KEGG信号通路富集分析。通过HMDD v3.0精准查询与子宫内膜异位症相关且经过验证(≥2次)的miRNA,并使用miRwalk 2.0数据库预测其靶基因。将预测的靶基因和GSE7305中的差异表达基因求得交集,获得miRNA和mRNA相互作用关系对。在C

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