我国部分地区庚型肝炎病毒(HGV)5'端部分基因序列的比较

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采用套式逆转录聚合酶链反应(RTnPCR)法,用5′端引物对我国部分不同地区HGVRNA阳性的血清进行扩增,扩增产物为391bp,将其纯化后连接到pGEMTEasy质粒上,然后进行测序。测序结果表明,5′非编码区可分为两部分,靠近5′端为保守区,靠近核心区50bp为高度变异区,而靠近5′非编码区的部分核心区的序列也较为保守。5株中国南方HGV的5′端基因序列与美国报道的GBVC和HGV的同源性分别在83.4%~89.1%和85.7%~90.3%,而5株之间的同源性超过91.4%,显示中国的HGV不同于美国报道的GBVC和HGV,而且在中国流行的HGV之间的基因序列较为保守。 Using reverse transcriptase polymerase chain reaction (RTnPCR) method, the 5 ’end primer was used to amplify the HGV RNA positive sera in some areas of China, and the amplified product was 391bp. After purification, it was ligated into pGEMEasy plasmid On, and then sequenced. Sequencing results showed that the 5 ’untranslated region could be divided into two parts, near the 5’ end, close to the 50 bp in the core region as a highly variable region, while some of the core regions close to the 5 ’non-coding region were also conserved. The 5 ’end sequences of HGV from 5 southern China were 83.4% -89.1% and 85.7% -90.3% homologous to the reported GBVC and HGV in the United States, respectively. However, The homology between them is more than 91.4%, indicating that HGV in China is different from the reported GBV-C and HGV in the United States, and the gene sequences between HGVs that are popular in China are relatively conservative.
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