摘要：为建立和优化色素辣椒的InDel标记PCR反应体系，筛选多态性良好且重复性高的引物，为InDel分子标记在色素辣椒辅助育种、品种纯度鉴定及遗传多样性分析等提供可靠的技术支持。采用正交试验、单因素试验方法，对影响扩增体系中的模板DNA用量、引物浓度、2×Taq PCR Mix添加量等参数进行3因素4水平的正交试验比较分析，对循环数进行单因素试验优化分析。结果表明，对InDel-PCR体系扩增结果的影响程度中引物浓度最大，其次是模板DNA用量，而2×Taq PCR Mix添加量的影响不大。根据检测结果，出于成本和模板DNA用量的考虑，确定最佳InDel-PCR反应体系（10 μL）：模板DNA用量为35 ng、引物浓度为0.5 μmol/L、2×Taq PCR Mix添加量为5 μL。扩增程序：94 ℃预变性3 min;94 ℃变性30 s，退火30 s，72 ℃变性60 s，35个循环;72 ℃变性5 min;扩增产物在4 ℃保存。从240对InDel通用引物中最终筛选出14对适用于色素辣椒InDel-PCR候选引物。InDel标记是基于PCR的分子技术，选择适宜的引物及模板DNA浓度对扩增出清晰、稳定的条带很重要，优化后的10 μL InDel-PCR反应体系及扩增程序，成功筛选出14条多态性较高的InDel引物，为后续的色素辣椒分子标记研究提供了可靠技术依据。
　　关键词：色素辣椒;InDel-PCR;反应体系;引物筛选;扩增产物;参数优化
　　中图分类号：S641.303