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为提高政府R&D投入绩效,提出基于组合分析的政府R&D投入绩效优化模型。考虑政府R&D投资项目目标和评估标准的异质性,建立模糊ANP模型对单个项目绩效进行评估;从整体的视角构建用于绩效优化的模糊多目标线性规划模型,并实现模型的求解;结合模型的构建及求解过程,讨论政府R&D投入绩效的优化方法。