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深刻认识多分辨率建模的哲学基础有利于推动多分辨率建模理论及其应用的不断深入发展，促进入们对复杂系统的进一步深化认识。在分析复杂系统研究需求和多分辨率建模发展历程和特点的基础上，总结出多分辨率建模是研究复杂系统的重要手段和工具。认为复杂系统多分辨率建模是对相应的哲学问题的辩证认识和体现，并提出在多分辨率建模实践中多样性思想是前提，层次观是基础，有序性思想是一致性维护的基础，整体论与还原论的结合是科学保证。