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检测基因组中的结构变异对遗传学研究具有重要意义,基于测序技术的结构变异检测将成为主流发展方向。全面总结了现有面向下一代测序技术的结构变异检测算法:配对末端匹配法、读深度法、分裂读数据法和序列拼接法,分析各算法核心思想及其特点,给出其适用范围和优缺点,并探讨了检测算法存在的问题和发展趋势。
面向下一代测序技术的结构变异检测算法综述
【摘 要】
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检测基因组中的结构变异对遗传学研究具有重要意义,基于测序技术的结构变异检测将成为主流发展方向。全面总结了现有面向下一代测序技术的结构变异检测算法:配对末端匹配法、
【机 构】
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上海理工大学系统生物医学研究中心
【出 处】
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计算机应用研究
【发表日期】
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2014年02期
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(31100902,31301092);上海市重点学科建设基金资助项目(S30501)
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