基于高通量测序和Q-PCR芯片技术分析养殖环境中苍蝇携带细菌菌群结构和耐药基因特点

来源 :东北农业大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：shtduswh

【摘要】

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利用高通量测序和定量聚合酶链反应芯片技术,分析和比较鸡舍和奶牛舍粪便和苍蝇细菌菌群结构、潜在致病菌以及耐药基因(Antibiotic resistance gene,ARG)和移动遗传元件(Mobi

【作者】

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张红娜周玉法崔娜翟真真

【机构】

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河北经贸大学生物科学与工程学院,泰安市岱岳区畜牧局,泰安市中心医院

【出处】

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东北农业大学学报

【发表日期】

：

2020年11期

【关键词】

：

苍蝇动物粪便高通量测序 Q-PCR 细菌菌群耐药基因移动遗传元件 flies animal feces high-throughput sequenci

【基金项目】

：

国家自然科学基金项目(81903282),河北省自然科学基金项目(C2020207012),河北省高等学校科学技术研究项目(QN2020242),泰安市科技发展计划项目(2019NS188),河北经贸大学科学研究与发展计划项目(2020YB14)

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利用高通量测序和定量聚合酶链反应芯片技术,分析和比较鸡舍和奶牛舍粪便和苍蝇细菌菌群结构、潜在致病菌以及耐药基因(Antibiotic resistance gene,ARG)和移动遗传元件(Mobile genetic element,MGE)。动物粪便和苍蝇样品中鉴定出13个共有细菌门,且优势菌门一致,分别为厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)。另外,从苍蝇和粪便样品中分别检测到32和

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