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人类癌症细胞中通常藏匿着多种引起恶性病变的染色体变异，核酸替换和表观遗传修饰。癌症基因组图谱（the can-cer genome atlas，TCGA）计划的目标是获取、刻画并分析人类癌症中大规模、多种变异的分子特征，并且为癌症研究者迅速地提供数据。本文对TCGA数据的四个产生流程以及包含的癌症种类、数据类型、数据水平、分析流程和常用的几种分析工具等进行阐述，同时以卵巢癌（ovarian cancer）为例详细介绍了TCGA数据在突变分析、拷贝数分析、表达分析和通路分析等方面的应用，并对TCGA研究团队近几年有关胶质母细胞瘤（glioblastoma，GBM）的研究方法和结果以及已经完成分析的癌症类型进行综述。