一种共调控基因聚类的新方法

来源 :吉林大学学报：理学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：zhanagyuxing

【摘要】

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定义了一种基于滑动匹配的相似度，并在此基础上提出一种能够自适应确定聚类数目的全局群均值算法，解决了现有共调控基因聚类方法无法考虑到基因的正反、延时、部分时间和差异表

【作者】

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白天周春光刘桂霞王晗王喆张宏婷

【机构】

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吉林大学计算机科学与技术学院

【出处】

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吉林大学学报：理学版

【发表日期】

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2009年2期

【关键词】

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共调控基因聚类全局K-均值相似度度量 co-regulating gene clustering global K-means similarity

【基金项目】

：

国家自然科学基金（批准号：60433020,60673099,60773095）、国家高技术研究发展计划863项目基金（批准号：2007AA04Z114）、吉林大学“985工程”项目基金、欧盟项目TH/Asia Link/010（批准号：111084）和教育部“符号计算与知识工程”重点实验室项目基金（批准号：93K-17）.

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定义了一种基于滑动匹配的相似度，并在此基础上提出一种能够自适应确定聚类数目的全局群均值算法，解决了现有共调控基因聚类方法无法考虑到基因的正反、延时、部分时间和差异表达全部4种共调控关系的问题．将提出的算法应用于微阵列数据中，并将实验结果与CLUSTER3．0算法进行了比较，验证了算法的可行性和有效性．

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