基于离散增量结合支持向量机方法的凋亡蛋白亚细胞位置预测

来源 :生物物理学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lxkeinsun
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根据凋亡蛋白的亚细胞位置主要决定于它的氨基酸序列这一观点,基于局部氨基酸序列的n肽组分和序列的亲疏水性分布信息,采用离散增量结合支持向量机(ID_SVM)算法,对六类细胞凋亡蛋白的亚细胞位置进行预测,结果表明,在Re-substitution检验和Jackknife检验下,ID—SVM算法的总体预测成功率分别达到了94.6%和84.2%;在5-fold检验和10-fold检验下,其总体预测成功率也都达到了83%以上.通过比较ID和ID_SVM两种方法的预测能力发现,结合了支持向量机的离散增量算法能够改进预
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