类蛋白质分子形成紧密接触对的速率研究

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采用Kolinski等建立的类蛋白质分子的格点模型,通过计算类蛋白质分子的末端距分布函数P(r)来研究类蛋白质分子形成紧密接触对的速率k.发现不同的氨基酸序列,其分布函数P(r)不同.对于序列(H)x和(P)x,分布函数P(r)有二个峰值;而对于序列(HP)x,分布函数P(r)只有一个峰值.对于类蛋白质分子形成紧密接触对的速率k,当链长N<11,随着N的增加而增加;当N>11,形成紧密接触对的速率k随着N的增加而减少,这个趋势与实验结果一致,并存在关系k~N-α(N>11),系数α与氨基酸序列有关.这些研
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