【摘 要】
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在已知的药物靶点中,G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor,GPCR)占绝大多数,它与高血压、哮喘、疼痛、神经和免疫紊乱等多种疾病有着密切联系。但由于GPCR的七次跨膜构
【机 构】
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重庆医科大学法医学与生物医学信息研究室; 重庆医科大学基础医学院数学教研室;
【基金项目】
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重庆医科大学基础医学院科研基金项目(2011)~~
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在已知的药物靶点中,G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor,GPCR)占绝大多数,它与高血压、哮喘、疼痛、神经和免疫紊乱等多种疾病有着密切联系。但由于GPCR的七次跨膜构象较复杂,其空间结构很难从实验中获取,因此,它们的功能就更难确定了。作者通过对已知蛋白质数据库中数据的分析,构建了两个不同的数据集,并利用蛋白质一级结构、基本理化性质及拓扑描述等特征,训练两组SVM分类器,预测GPCR中潜在的药物靶点。综合分析两组分类器的结果发现,其中有141个GPCR同时被这两组分类器预测为药物靶点。在这141个GPCR中,有39个同时存在于TTD数据库中。
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