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分析上海市黄浦区2013—2016年麻疹病毒分离株核蛋白基因特征。
方法2013—2016年上海市黄浦区麻疹实验室共采集72例疑似麻疹病例咽拭子标本，用Vero/hSLAM细胞进行病毒分离，经real-time RT-PCR方法鉴定为阳性的麻疹病毒分离株，采用RT-PCR方法扩增麻疹病毒N基因核苷酸片段（450 bp），对扩增产物进行序列测定和基因特征分析。
结果72例疑似麻疹病例中分离到40株麻疹病毒。40例阳性病例中，男性23例（57.5%），女性17例（42.5%），年龄为（19.07±16.52）岁。40株麻疹病毒的基因亲缘关系显示，39株为H1基因型中的H1a基因亚型，并且有2个明显分支，另外1株为B3基因型。39株H1a基因型麻疹病毒株与同型参考株MVi/Hunan.CHN/0.93/7（AF045212）的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.8%~100.0%和96.6%~100.0%。
结论H1a基因亚型是上海市黄浦区2013—2016年本地麻疹流行的优势基因亚型，同一年份存在着不同的传播链。分离的病毒株在核苷酸和氨基酸序列水平上高度保守，关键功能位点未发生变异。