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目的
利用GeXP系统结合多重PCR技术,建立诺如病毒(GI和GII组)、轮状病毒、星状病毒的方法。
方法根据4种病毒的序列特征,制备病毒标准品质粒,收集病原体样本,利用GenBank下载4种病毒的核苷酸序列,根据4种病毒的序列特征,利用GeXP express Profiler设计特异性引物,优化条件使GeXP系统能够特异性、快速的检测对应病毒。评价其灵敏度、特异性及功效,并应用于120份临床标本检测。
结果优化后的引物能特异性的检测各病毒,无交叉反应;灵敏度为100%,特异性为99.53%,功效为99.62%,与荧光定量PCR检测结果一致性为99.51%,检测浓度最低至5×103/μl拷贝,在已知临床样本灵敏度高、特异性好。
结论GeXP方法的建立为快速、准确的检测这4种腹泻病毒提供了便利,对口岸突发群体性腹泻的病原体检出有重要意义。