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在人类基因组上正确识别转录调控信号仍然是分子生物学界面临的重要挑战，目前计算的手段仍然是寻找转录调控元件的主要方法。然而这些方法普遍存在假阳性率过高的问题，而降低假阳性率的方法之一就是参数的优化选择。这些预测算法都普遍需要一个背景序列集作为训练集合中的阴性集合，我们假设背景序列集合的选择对预测算法的预测能力会产生重要影响，然而目前很少有人研究背景序列的选择问题。本文就组织特异的转录调控元件预测模型的背景序列集的选择问题进行了探讨。我们的研究结果表明，根据该组织特异的转录因子结合位点序列的GC含量选择的背景