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互联网时代下发展创新创业教育,是激发全民族创新意识、推动中国特色社会主义经济高速发展的重要途径,也是高校由传统教育模式向现代化教育模式转变的一个重要突破点,更是高校教育成果、科研成果向经济成果转化的高效方式之一.但大学生创新创业项目孵化期间,由于项目运作经验不足,造成项目运行中形成诸多问题.本文以我国高校创新创业发展为背景,以互联网时代下创新创业项目孵化保护为切入点,梳理了现今我国高校创新创业项目孵化中存在的创新创业基地主要职能定位、公司筹建与组织管理、股权架构设计、融资方式与风险规避、知识产权保护方法、项目参与者权益维护途径等方面存在的风险,并提出了相应的防范措施,同时对发展适合高校创新创业项目孵化的保护新路径、新模式进行了探索.