【摘 要】
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随着新一代生物技术和生物信息学的发展,研究发现,在真核生物转录组中存在大量长非编码RNA(long non-codingRNA,lncRNA),而这些lncRNA可能在基因表达调控过程中起到关键性的
【机 构】
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中国矿业大学信息与电气工程学院,中国科学院北京基因组研究所计算生物学研究中心
【基金项目】
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中国博士后科学基金资助项目(2012M511335,2012M511336);中央高校基本科研业务费专项基金资助项目(2010QNA47,2010QNA50);霍英东教育基金会青年教师基金资助项目(121066)~~
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随着新一代生物技术和生物信息学的发展,研究发现,在真核生物转录组中存在大量长非编码RNA(long non-codingRNA,lncRNA),而这些lncRNA可能在基因表达调控过程中起到关键性的功能作用.当前lncRNA研究主要采用高通量RNA-Seq测序技术,并通过生物信息学方法对测序数据进行处理和分析,以挖掘其中lncRNA的序列、结构、表达及功能等信息.本文将对基于RNA-Seq的lncRNA预测流程进行介绍,对其中涉及的生物信息学方法进行较为全面的综述,就相关问题和挑战展开讨论,并对研究进行展望.
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