【摘 要】
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利用转录测序技术,开发油梨表达序列标签.简单重复序列(EST-SSRs),为SSR标记在油梨种质资源鉴定、品种选育及遗传连锁图谱构建奠定基础。采用Illumina二代测序的技术,共获得3
【机 构】
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中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业农村部华南作物基因资源与种质创制重点实验室/农业农村部热带作物种子种苗质量监督检验测试中心,农业农村部科技发展中心,广西南亚热带农业科学研究所
【基金项目】
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海南省自然科学基金项目(No.20153118)
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利用转录测序技术,开发油梨表达序列标签.简单重复序列(EST-SSRs),为SSR标记在油梨种质资源鉴定、品种选育及遗传连锁图谱构建奠定基础。采用Illumina二代测序的技术,共获得37639条无冗余的序列,对其进行SSR搜索,共获得6419条简单序列重复(SSR)。利用Primer 3.0软件设计SSR引物,并以11份油梨种质筛选多态性引物。基于转录组序列开发出的EST-SSR的分布频率为17.05%。在油梨EST-SSR中,单核苷、二核苷和三核苷的重复占主导,占总数的99.07%。单、二、三核苷酸重
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