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文章运用陕西省237家企业实地微观调研数据,采用DEA模型测度了企业科技创新效率。研究发现,样本企业科技创新效率总体水平偏低,处于不同行业的企业科技创新效率存在明显差异;样本地区经济发展水平和企业科学管理决策水平之间存在着不适应性。在此基础上,运用Tobit模型探讨了不同来源科技金融投入对科技创新效率的影响机理。研究结果表明,政府财政科技投入、科技资本市场投入和企业成立年限对企业科技创新效率具有显著正向影响;企业内部科技投入与金融机构科技贷款对科技创新效率具有显著负向作用;科技金融投入对不同性质企业科技创新效率的影响存在异质性。据此提出提升企业科技创新管理决策水平、拓宽融资渠道、加大政府政策扶持力度、完善地方科技资本市场等政策建议。