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对脂肪酶采取一定的预处理可以改善其催化活性、稳定性和选择性,主要方法有固定化、分子印迹、表面活性剂或葡聚糖修饰等.同种脂肪酶对糖环上不同羟基的选择性由糖或糖苷的结构以及溶剂的极性来决定.反应的副产物水、甲醇等对反应转化率和酶活都有影响,针对不同体系有分子筛吸附、减压低共沸蒸馏、饱和盐溶液控制水活度等解决方案.溶剂的选择是脂肪酶促糖酯合成反应的关键,既要对2种底物都有可观的溶解度又不能对酶活有很大的负面影响,当前的策略有复合溶剂、离子液体、无溶剂体系、对糖进行修饰、拟固态法和过饱和溶液等.