预测RNA二级结构的一种遗传模拟退火算法

来源 :武汉大学学报：理学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：huangwei0541

【摘要】

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讨论了RNA二级结构的预测问题，首先提出一种用树表示RNA二级结构的方法，然后给出一种用于预测RNA二级结构的混合遗传算法——遗传模拟退火算法．在该算法中，个体(RNA二级结构)直接

【作者】

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任清华莫忠息陶玉敏

【机构】

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武汉大学数学与统计学院

【出处】

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武汉大学学报：理学版

【发表日期】

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2004年1期

【关键词】

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RNA二级结构遗传算法模拟退火算法树结构预测模型 RNA secondary structure genetic algorithm simulat

【基金项目】

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国家自然科学基金资助项目(30170214)

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讨论了RNA二级结构的预测问题，首先提出一种用树表示RNA二级结构的方法，然后给出一种用于预测RNA二级结构的混合遗传算法——遗传模拟退火算法．在该算法中，个体(RNA二级结构)直接用茎序列编码，与个体用二进制串编码的同类型算法相比，在很大程度上缩短了个体的编码长度．计算结果表明该预测算法具有较高的精度．

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