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阳澄湖是太湖平原上第三大淡水湖泊和苏州市重要的综合水源。从2004年3—10月对阳澄湖进行了3次浮游植物的调查,共发现浮游植物8门83属211种（包括变种）,其中阳澄西湖71属153种、阳澄中湖68属140种、阳澄东湖74属151种。并利用浮游植物的生物学多样性指数对阳澄湖进行了水质评价,该水体整体处于重污染状态,且污染呈西高东低分布。