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为解决双光子荧光显微成像系统轴向扫描问题,提出一种基于数字微镜(DMD)的快速轴向扫描系统。该系统采用DMD选择光路,不同光路放置不同焦距的透镜组对光束发散角产生不同的改变,经物镜聚焦后得到不同深度的轴上扫描点。对该系统的轴向扫描距离、扫描点位置及衍射效率进行了理论计算仿真,结果表明:扫描系统采用4个模块以及5个模块时其轴向扫描距离均可达到1mm,4模块系统中透镜的焦距为297.3mm,5模块系统中透镜焦距为361.47mm。轴向扫描点除边缘点外线性分布,轴向扫描频率达到几十kHz,满足脑神经成像的要求。