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认识世界,改造世界首先要解决方法问题,地方病与地质环境关系研究涉及多个学科,不同于传统的水文地质、环境地质调查。它也不是单纯的病理研究,而是综合地质学、水文地质学、水文地球化学、医学、生物学的一项复杂的系统工程。这一系统的科学方法论问题包括研究的对象、理论工具、思维的形式与方法以及物质手段。现简要地介绍有关地方病与地质环境关系研究的科学方法问题以及几个相关的注意问题。