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本发明采用非溶剂引起相分离的方法，将聚合物溶解在溶剂之中形成溶剂相，将亲水性药物溶解在非溶剂中形成非溶剂相，然后将前者注入后者之中，在室温下挥发溶剂，透析，以除去未包封的药物，冷冻干燥成粉，即得生物降解聚合物药物微球。本发明可以使水溶性药物的包封率达到20％以上，微球粒径在150nm以下，能满足更多的使用要求。