现有的科研经费分配机制大多数是竞争性的,容易导致科研经费分配的不均衡现象.如何准确度量经费分配的均衡度成为科研管理领域的一个重要问题.基尼系数常用于刻画科研经费分配的均衡度,然而由于样本选择等原因,现有研究在使用基尼系数刻画科研经费均衡度时存在度量偏差.总结分析了度量偏差的2个来源,一是在研究对象层面上,现有研究多数是从机构层面来度量科研经费分配均衡程度,忽略了机构规模带来的影响;二是在统计口径上,现有的研究假设获资助科研人员即为机构科研人员的总体,科研人员基数的统计口径作了简易处理,造成了经费分配不均衡度的高估或低估.从理论层面阐述了度量偏差的形成机理和改进方法.以2011—2015年中国科学院科研人员获得资助的项目数据为例,计算了中国科学院研究所和科研人员的经费基尼系数,并对比分析了机构与个人层面、名义与实际科研人数对基尼系数产生的度量偏差.结果表明,中国科学院机构经费分配较为均衡,而个人科研经费集中程度较为明显.以机构层面的基尼系数来表示中科院科研经费分配均衡度,低估了科研经费在科研人员间分配的不均衡程度;而传统研究中仅研究获资助人员间的分配状况,严重低估了科研经费分配的不均衡程度.