观赏植物DFR基因的密码子使用模式比较

来源 :分子植物育种 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cuileidan
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
二氢黄酮醇4-还原酶(dihydroflavonol 4-reductase, DFR)是植物类黄酮代谢途径的关键酶之一,在植物花色修饰起重要作用。本研究以观赏植物的21个DFR基因为研究对象,利用CodonW和MEGA5.05等软件分析其密码子使用模式,探讨影响密码子使用偏性的主要因素。结果表明:观赏植物DFR基因密码子使用偏性较弱;DFR基因在单/双子叶观赏植物之间的密码子使用偏好性存在差异;单子叶观赏植物偏好以G/C结尾,而双子叶观赏植物偏好使用A/T结尾。有效密码子数分析显示,大部分观赏植物DFR基因(占供试材料76.19%)分布于期望曲线下方;奇偶偏好分析发现,嘌呤(A和G)和嘧啶(T和C)的使用频率存在不均衡使用。由此可推测观赏植物DFR基因的密码子偏性使用模式受到突变压力和选择作用等因素的共同影响。此外,还确定了ATT等倾向以A/T结尾的15个最优密码子。本研究结果为观赏植物花色转基因研究中的密码子改造及优化提供了理论参考。
其他文献
不锈钢波纹管换热器是近年来我国研制的高效新型换热设备,与传统列管式换热器相比具有传热系数高,不易结垢,设备重量轻等优点,目前,已大量替代普通列管式换热器,成为供热、供
期刊