有向基因组移位排序问题的O(n^2)快速算法

来源 :计算机学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bolen9999
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
有向基因组移位排序问题在计算生物学研究中占有重要位置.以前最好的算法时间复杂度为O(n2logn).该文给出一个有向基因组移位排序的新多项式算法,将移位排序的时间复杂度改进为O(n2).算法改进的关键在于找到一种寻找有效合理移位的新方法,通过在最小子排列中删除无关顶点确定一个合理移位是否有效,从而将寻找一个有效移位的时间复杂度改进为O(n),总时间复杂度由此降为O(n2).
其他文献
针对当前Internet上日益复杂的网络业务流和视频流,文章提出了一种新的多重分形小波模型.与普通的多重分形小波模型(Multifractal Wavelet Model, MWM)不同的是,该文提出的新