大花序桉顶芽转录组SSR位点信息分析

来源 :中南林业科技大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:solonxpl
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【目的】分析珍贵用材树种大花序桉转录组SSR位点信息,旨在为开发新的大花序桉功能基因相关的多态性SSR标记提供理论基础。【方法】以2年生大花序桉顶芽为试验材料,基于Illumina HiSeq X Ten高通量测序技术平台获得其转录组序列数据,利用MISA软件对全部无冗余Unigene序列进行SSR位点检索和分析,并使用Primer 3软件进行SSR引物设计,以研究大花序桉顶芽转录组中的SSR位点分布特征及多态性标记开发潜力。【结果】大花序桉26587条转录组Unigene中共获得12366个SSR位点,
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