蛋白质折叠速率与其氨基酸序列极性的关系

来源 :生物信息学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jeff2001
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以大肠杆菌60个蛋白酶以及几种常见病毒(SARS病毒、艾滋病病毒、丙型肝炎病毒及乙型肝炎病毒)各蛋白质序列中的所有α-螺旋和β-折叠片段为研究对象,计算了各片段的折叠速率和平均极性,分别在各物种的α-螺旋和β-折叠两类二级结构片段中分析了二者的相关性。得到结论:不论是大肠杆菌中的蛋白酶还是病毒蛋白,其中的两类氨基酸片段的平均极性与折叠速率都是极显著相关的:对于所有的α片段,二者呈线性正相关,而对于所有的β片段,二者成线性负相关。结果证实了在蛋白质折叠中,氨基酸的极性起着重要的作用。
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