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随着国家对科研经费投入的逐年加大，我国高等教育事业的持续发展，各大高等院校也积极开展各式各样的科研项目，并且取得了一定的科研成果。但从整体来看，高校的科研成果在质量上和数量上，并不能让人完全满意，主要是由于高校科研经费绩效考评不够完善，进而造成科研经费在使用上缺乏严格管理。本文主要阐述现阶段我国高校科研经费在使用上存在问题，以及讨论如何完善高校科研经费绩效评价制度。