鸡催乳素基因序列多态及生物信息学分析

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选择繁殖性能具有明显差异的4 个鸡品种(莱航鸡、阳山鸡、丝羽乌骨鸡和隐性白洛克鸡)构建品种 DNA池,采用测序的方法快速筛查鸡催乳素基因(chicken prolactin,cPRL)5′侧翼调控区、外显子区和部分内含子区约4500 bp范围内可能与产蛋性能相关的序列多态,共检测到13个SNPs和两个短片段(24 bp和15 bp)插入/缺失多态,其中在5′侧翼序列筛查到9个SNPs及两个短片段插入/缺失多态,在第2外显子筛查到1个SNP,在第5 外显子筛查到两个SNPs,在第2内含子筛查到1个SNP;进一步利用生物信息学分析cPRL 基因的5′侧翼调控序列,发现24 bp短片段的插入使莱航鸡比阳山鸡多出了1个Evi 1可能的结合位点(93分),C 2402T的变异则使阳山鸡比莱航鸡多出了1个C/EBPbeta可能的结合位点(94分),这两个结合位点是否影响 cPRL 基因的表达,影响鸡的就巢性和产蛋性能,还需要进一步研究。
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