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光合细菌（PSB）在自然界中分布非常广泛，可以认为凡是光能所及之处均可发现它们的踪迹。在海洋、江河、湖泊、池沼、土壤、水田、极地或温泉、高盐水体等各种生境中都有光合细菌，在氧气含量有限而光线能到达的表面水、泥中数量最多，可达10m个菌体／mL。20世纪前半叶，人们一直没有发现光合细菌的实际应用价值。