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农业生产活动如土地的农业利用，耕作，作物间套种植方式，放牧，农药化肥的使用以及农业动植物遗传改良（包括外来引入）等是农业生产力提高的重要途径，同时也是影响生物多样性的重要因素之一。土地的不合理开发利用易导致生境破碎，生物多样性下降，大规模的机械耕作导致土壤动植物区系的变化，甚至某些物种的消失，农药（除草剂，杀虫剂等）的高度使用使非靶标动植物受到伤害，品种改良，外来种的引入以及远缘外源遗传物质的利用