【摘 要】
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利用长PCR扩增漳州西施舌线粒体DNA(ZZ-mtDNA),用引物步移法测序,获得线粒体基因组DNA全序列,研究其基因组特点.结合双壳类49个物种线粒体全基因组,分析基因间核苷酸和蛋白质
【机 构】
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淮海工学院海洋学院,南京农业大学资源与环境科学学院
【基金项目】
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中央财政支持地方高校发展专项资金资助;江苏省自然科学基金;江苏省青蓝工程人才基金;江苏省海洋生物技术重点实验室开放课题;江苏省海洋资源开发研究院科技开放基金;国家自然科学基金
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利用长PCR扩增漳州西施舌线粒体DNA(ZZ-mtDNA),用引物步移法测序,获得线粒体基因组DNA全序列,研究其基因组特点.结合双壳类49个物种线粒体全基因组,分析基因间核苷酸和蛋白质氨基酸序列的差异,构建系统进化树,探讨漳州西施舌系统演化地位.研究结果表明:漳州西施舌线粒体基因组DNA全长17 199 bp,A+T含量为64.2％,编码36个基因,其中12个蛋白质编码基因,22个转运RNA基因(tRNAs),2个核糖体RNA基因(lrRNA和srRNA),全部基因均位于重链上,tRNASer为单拷贝,tRNAMet为双拷贝；非编码区占10.9％(1882bp/17 199 bp),其中,主非编码区为882 bp,与RZ-mtDNA主非编码区差异明显,另有一个较大(400 bp)的非编码区为漳州西施舌特异性非编码区；以双壳纲帘蛤目文蛤属3种贝类、贻贝目贻贝属4种贝类、珍珠贝目牡蛎科的6种贝类为参照,对编码基因的核苷酸序列和蛋白质氨基酸序列进行差异分析显示,漳州西施舌与日照西施舌达到了种间差异水平.线粒体基因组编码的基因、tRNA组成、非编码区均揭示漳州西施舌是腔蛤蜊属的一个新种.
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