洋葱伯克霍尔德菌群3种鉴定方法的比较

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为了比较VITKE 2 COMAPCT、 VITEK MS质谱、 16s rDNA基因测序3种方法鉴定洋葱伯克霍尔德菌群的异同,挑选15株从米面制品、淀粉及其制品中分离得到的洋葱伯克霍尔德菌群的菌,分别用VITEK 2 COMPACT、 VITEK MS质谱和16s rDNA基因测序进行鉴定。结果显示, VITEK 2COMPACT只能鉴定到群水平,可信度88%-99%;VITEK MS质谱可鉴定到种水平,鉴定置信度99%;16s rDNA基因测序可鉴定到种水平,序列同源性能达到99%以上,但每株菌16s
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