基于高通量测序分析蟹糊微生物菌群多样性

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目的:分析不同贮藏温度下蟹糊微生物菌群结构。方法:以4℃贮藏3天和-20℃贮藏的蟹糊为研究对象,采用Illumina MiSeq高通量测序技术对16S rDNA,V1-V3,V3-V4区域测序,并进行OTU聚类、Alpha多样性、物种分类分析。结果表明:(1)-20℃贮藏3天蟹糊样品V1-V3,V3-V4区域扩增所得微生物菌属分别为18和26属,4℃贮藏3天的蟹糊样品V1-V3和V3-V4区域扩增分别获得16和19属。(2)相对丰度大于1%的菌群为肉食杆菌属(Carnobacterium)、Jeotgalibaca、环丝菌属(Brochothrix)、葡萄球菌属(Staphylococcus)、嗜冷杆菌属(Psychrobacter)、弧菌属(Vibrio)。(3)-20℃贮藏3天的蟹糊样品优势菌群为肉食杆菌属(V1-V3,68.81%; V3-V4,69.29%)、弧菌属(V1-V3,16.75%; V3-V4,14.39%)。(4)4℃贮藏3天的蟹糊样品优势菌群为肉食杆菌属(V1-V3,73.37%;V3-V4, 70.35%), Jeotgalibaca(V1-V3,11.82%;V3-V4,12.35%),葡萄球菌属(V1-V3,5.45%;V3-V4,5.01%)。结论:蟹糊在不同贮藏温度下优势微生物、菌群多样性、丰度及比例等均存在显著(P<0.05)差异,在4℃贮藏过程中,Jeotgalibaca和葡萄球菌属比例明显上升,这可能是4℃下放置时间过长易导致食物中毒的主要原因。本研究为有效预防腌制生食蟹糊食源性疾病的发生及控制技术的开发提供了理论依据。
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