基于ceRNA探讨白藜芦醇干预肾透明细胞癌的有效机制

来源 :世界科学技术:中医药现代化 | 被引量 : 0次 | 上传用户：joy197671599

【摘要】

：

目的利用从肾透明细胞癌(ccRCC)数据集中筛选的差异表达基因、差异lncRNA及其上游miRNA,探索白藜芦醇可能的作用靶点,构建ccRCC的ceRNA网络。方法从基因表达综合数据(GEO)及

【作者】

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谢天琪裴丽霞宋亚芳孙梦珠赵婷婷易越孙建华

【机构】

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南京中医药大学附属医院

【出处】

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世界科学技术:中医药现代化

【发表日期】

：

2020年12期

【关键词】

：

肾透明细胞癌 ceRNA网络白藜芦醇 Renal clear cell carcinoma CeRNA network Resveratrol

【基金项目】

：

国家自然科学基金委员会面上项目(81473748):基于MC活化-PAR2-CGRP环路探讨电针治疗PI-IBS模型大鼠内脏高敏感的作用机制,负责人:孙建华,江苏省中医药管理局领军人才项目(SLJ0206):肠易激综合征针灸临床及效应机制研究,负责人:孙建华,江苏省中医院高峰人才项目(y2018rc05):针灸治疗功能性胃肠病临床及其效应机制,负责人:孙建华

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目的利用从肾透明细胞癌(ccRCC)数据集中筛选的差异表达基因、差异lncRNA及其上游miRNA,探索白藜芦醇可能的作用靶点,构建ccRCC的ceRNA网络。方法从基因表达综合数据(GEO)及转录组数据库(TCGA)中检索并筛选ccRCC基因及lncRNA表达数据集,对差异表达基因(DEGs)进行富集和功能注释,使用在线数据库预测miRNA及长链非编码RNA(lncRNA),通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定该机制中可能的lncRNA,建立竞争性内源性RNA(ceRNAs)调控网络,并通过网络

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