基于基因芯片数据的代谢网络重构及其应用

来源 :北京生物医学工程 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kkyilian2
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目的基因组尺度的代谢网络重构提供了一种从系统层面深入观察生物体的方法,由此重构得到的网络是个体的“全基因组网络”。鉴于这种网络不能反映出不同环境条件下细胞内的动态变化过程,本文给出一种从基因芯片数据出发对生物体的实时“工作网络”进行重构的方法。方法通过对基因芯片数据使用dChip软件计算探针的P—Acall后可得到基因的表达谱,然后在所整合的多源数据库的辅助下经由“基因表达谱→酶→反应→代谢网络”的过程进行“工作网络”的自动化重构。结果对来源于14种组织的182个干细胞样本进行工作网络重构的结果表明,所有
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