猪圆环病毒2型甘肃株全基因组克隆及序列分析

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参照GenBank中登录的猪圆环病毒2型(PCV-2)全基因组序列,设计合成了两对特异性引物,从甘肃白银疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)病料中提取病毒DNA,分步扩增全基因组.回收PCR产物,将其插入pGEM-T Easy载体,构建了重组质粒pGEM-PCV-2,转化后筛选、提取阳性重组质粒进行测序.结果表明,克隆到的PCV-2全基因组长度为1 767 bp.应用DNA Star序列分析软件,对所测PCV-2序列与GenBank中登录的包括甘肃在内的国内外PCV毒株进行同源性分析.结果显示,克隆的PCV-2与英国株(UK-EU656143)遗传关系最近,其核苷酸和推导的氨基酸序列同源性高达96.2%和91.0%,与已报道的2株甘肃毒株(GS03-EU547458,GSLZ-FJ447482)遗传关系较远,可能是流行于甘肃白银的一个变异毒株(GSBY).
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