青海弧菌荧光素酶蛋白三维结构的分子模拟研究

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基于荧光素酶催化发光的生物发光技术在化学、生命与环境科学等领域得到广泛应用.部分萤火虫和发光细菌的荧光素酶晶体三维结构已经解析出来.青海弧菌(Vibrio qinghaiensis sp.-Q67,简称Q67)是从青海湖青海裸鲤中提取的一种新型淡水发光细菌,已用于化学品的生物检测及毒性评价.然而,其催化发光过程中最重要的荧光素酶三维结构尚未解析,阻碍了化学品对Q67产生毒性的机理研究进程.本工作通过异源二聚体同源建模与分子动力学模拟方法构建了Q67荧光素酶的三维结构.研究结果表明,Q67荧光素酶蛋白有α和β两个多肽亚基,范德华力是维持α/β稳定结构的主要作用力,而α/β亚基携带的净电荷产生的静电相互作用不利于体系稳定.缔合的专一性则由α/β亚基接触面上的极性基团之间的氢键实现.底物黄素单核苷酸与Q67荧光素酶的结合位点在α亚基活性口袋中,β亚基有利于保持α亚基活性口袋的稳定性.
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