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用分子标记技术对河西走廊4种不同生态型芦苇进行了遗传多态性分子标记分析。从30条ISSR引物和45条RAPD引物中分别筛选出适合4种不同生态型芦苇分析的9条和13条引物，前者共扩增出99条带，多态性位点数为51；后者共扩增出195条带，多态性位点数为87。两种分子标记分析所得的遗传相似系数呈显著正相关（r=0．845，P〈0．05）。4种生态型芦苇表现出由水生芦苇经盐渍芦苇向沙丘芦苇逐渐演化的趋势。