条斑紫菜Rab1基因的克隆与生物信息学分析

来源 :青岛农业大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:ADCADC111111
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Rab蛋白是小分子量GTP结合蛋白家族中的成员之一,它与植物抗逆性密切相关。以拟南芥Rab基因序列为探针,通过筛选条斑紫菜EST数据库中的同源序列,拼接出了其Rab1基因的含有完整开放阅读框(ORF)的cDNA序列。根据拼接的序列设计引物,利用RT—PCR成功克隆了条斑紫菜Rab1基因的cDNA。T—A克隆后测序结果显示其cDNA含有长615bp的完整ORF,编码产物含203个氨基酸残基,分子量为22.5kDa。条斑紫菜Rab1与拟南芥Rab1聚为一类,它与多种生物的Rab1具有较高的序列一致性。
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