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米曲霉（Aspergillus oryzae）酸性蛋白酶与部分商品化的蛋白酶相比,具有对大豆蛋白水解效率高且水解产物苦味弱的特性。作者采用RT-PCR技术克隆获得酸性蛋白酶（Ap）基因,结合生物信息学手段,对Ap进行分析与预测。结果表明：Ap基因对密码子使用频率具有偏好性,特别是第3位密码子对GC碱基的使用频率高,达到74%;编码404个氨基酸残基。Ap属于胞外天冬氨酸蛋白酶。以海枣曲霉（A.phoenicis）的酸性蛋白酶（PDB code：1IBQ）作为模板同源建模结果可知,Ap分子至少能与2个Zn2